Next-generation RNA switches through AI-based design: TU researchers develop a synthetic NAND switch in living cells

An interdisciplinary research team from two working groups at the Centre for Synthetic Biology at TU Darmstadt has developed the first RNA-based genetic switch that precisely replicates the logical behavior of a NAND gate, one of the most important building blocks of digital circuits. The results were published in the journal Nucleic Acids Research. Quelle: IDW Informationsdienst Wissenschaft

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RNA-Schalter der nächsten Generation: Forschende entwickeln mit KI synthetischen NAND-Schalter in lebenden Zellen

Ein interdisziplinäres Forschungsteam aus zwei Arbeitsgruppen des Centre for Synthetic Biology der TU Darmstadt hat erstmals einen RNA-basierten genetischen Schalter entwickelt, der das logische Verhalten eines NAND-Gatters, eines der wichtigsten Bausteine digitaler Schaltungen, präzise nachbildet. Die Ergebnisse wurden im Fachjournal „Nucleic Acids Research“ veröffentlicht. Quelle: IDW Informationsdienst Wissenschaft

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Neue Therapieoption bei idiopathischer Lungenfibrose

Team aus der Gießener Lungenforschung entdeckt zentrale Rolle des RNA-bindenden Proteins Fused in Sarcoma (FUS) Quelle: IDW Informationsdienst Wissenschaft

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Sind zuckerhaltige RNA-Moleküle als Signalstoffe für das Immunsystem unterwegs?

Die RNA hat viele wichtige Funktionen in unserem Körper und wird seit kurzem auch als Corona-Impfstoff genutzt. Doch das Lebensmolekül ist längst noch nicht lückenlos durchschaut. Sind zuckerhaltige RNA-Moleküle als Signalstoffe für das Immunsystem unterwegs? Quelle: FAZ.NET

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A global assessment of cancer genomic alterations in epigenetic mechanisms

Muhammad A Shah, Emily L Denton, Cheryl H Arrowsmith, Mathieu Lupien and Matthieu Schapira Abstract Background The notion that epigenetic mechanisms may be central to cancer initiation and progression is supported by recent next-generation sequencing efforts revealing that genes involved in chromatin-mediated signaling are recurrently mutated in cancer patients. Results Here, we analyze mutational and transcriptional profiles from TCGA and the ICGC across a collection 441 chromatin factors and histones. Chromatin factors essential for rapid replication are frequently overexpressed, and those that maintain genome stability frequently mutated. We identify novel mutation hotspots such as K36M in histone H3.1, and uncover…

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Three-dimensional super-resolution microscopy of the inactive X chromosome territory reveals a collapse of its active nuclear compartment harboring distinct Xist RNA foci

Daniel Smeets, Yolanda Markaki, Volker J Schmid, Felix Kraus, Anna Tattermusch, Andrea Cerase, Michael Sterr, Susanne Fiedler, Justin Demmerle, Jens Popken, Heinrich Leonhardt, Neil Brockdorff, Thomas Cremer1, Lothar Schermelleh and Marion Cremer Abstract Background A Xist RNA decorated Barr body is the structural hallmark of the compacted inactive X territory in female mammals. Using super-resolution three-dimensional structured illumination microscopy (3D-SIM) and quantitative image analysis, we compared its ultrastructure with active chromosome territories (CTs) in human and mouse somatic cells, and explored the spatio-temporal process of Barr body formation at onset of inactivation in early differentiating mouse embryonic stem cells (ESCs)….

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